Résumé: Dans les domaines de la bioinformatique et de la chimie computationnelle, le docking moléculaire est une technique essentielle pour prédire la position et l’orientation d’une molécule (ligand) lorsqu’elle interagit avec une protéine cible. Cette méthode est cruciale pour la découverte de médicaments, l’étude des mécanismes moléculaires et la compréhension des interactions biomoléculaires à l’échelle atomique. Cependant, la nature NP-difficile du docking moléculaire présente des défis computationnels importants. Ce projet explore l’utilisation de l’optimisation par essaim d’abeilles (Bee Swarm Optimization, BSO) et sa parallélisation avec OpenACC sur les accélérateurs ( comme les GPU) pour relever ces défis. L’objectif est de déterminer dans quelle mesure la parallélisation sur GPU réduit le temps d’exécution par rapport aux implémentations séquentielles.

Alger:
Langue: Français
Collation: 68 p. ill. ;30 cm.
Diplôme: Master
Etablissement de soutenance: Alger, Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumediene. Faculté d’Informatique

Mots clés:
docking moléculaire

Note: Annexe pp.59-62; Bibliogr.pp.63-68